S:t Peters kyrka är den första kyrkan ritad av arkitekten Erik Lallerstedt som på sikt blev känd som en radikal arkitekt. Efter att metodistförsamlingen hade hyrt in sig på flera olika adresser fick de möjlighet att bygga kyrkan - den tredje metodist kyrka i Stockholm. Stilen på kyrkobyggnaden kan beskrivas som jugend med drag av nygotik. Hörnpelaren vid entrén pryds av en skulpturgrupp i huggen sandsten föreställande Kristus tröstaren.

Det tog flera år för församlingen att spara till vad som blev Sveriges första Walcker orgel, som för några år sedan renoverades till ursprungsskicket.

Efter ytterligare några år ville församlingen få en altartavla målad. År 1925 tillkom altarmålningen, vilket utfördes av Olle Hjortzberg. Motivet är Kristi liv från födseln i stallet i Betlehem till den tomma graven i Jerusalem.

Ett lekhörn för barn byggdes för några år sedan men för övrigt har inga förändringar skett i kyrksalen.